元神技能的选择直接影响通关效率和层数突破。元神系统是游戏40级后开放的核心玩法，元神达到五重景宵境·初即可开启元神技能功能。玩家可以将一名符合条件的英雄放入元神中成为元神英雄，系统会自动指定该英雄的一个技能作为元神技能，战阵中的所有英雄都能共享使用该技能，但共用同一个冷却时间。选择元神技能时需要考虑技能效果与队伍整体战术的适配性，以及元神英雄的培养程度。
迷宫玩法随着层数提升难度会呈指数级增长，前20层每5层有一次回复机会，20层后变为每10层才有一次回复机会。这种情况下，元神技能的选择更倾向于能够提供团队增益或关键控制的类型。唐僧的元神技能能够为全队增加10%法强，这种稳定提升输出的技能在迷宫后期对抗高防御怪物时尤为重要。另一个推荐选择是嫦娥的元神技能，能够为队伍提供持续治疗效果，弥补迷宫后期回复机会减少的困境。元神技能的伤害或治疗效果仅与元神属性相关，与元神英雄自身属性无关，因此不必过分追求元神英雄的装备强度。
从元神英雄的筛选条件来看，必须满足不在战阵中、等级达到70级、星级5星、飞升7级等要求。这意味着玩家需要提前规划好主力阵容和元神英雄的培养路线。由于元神技能共享冷却时间，频繁切换使用不同元神技能反而会降低效率，建议专注于培养1-2个核心元神技能。在迷宫高层，暴击属性尤为重要，元神系统提供的暴击加成最高可达40%配合装备和经文联协的暴击加成，能显著提升输出效率。这种情况下，选择能强化暴击效果或配合暴击打法的元神技能会更有利于迷宫推进。
迷宫玩法的阵容搭配通常采用双输出加一治疗的组合，元神技能的选择也应围绕这一核心配置展开。输出型元神技能如二郎神的天眼虽然伤害可观，但在高层迷宫中不如团队增益型技能实用。治疗型元神技能虽然能提高生存能力，但会占用宝贵的输出时间。最理想的情况是选择既能提供增益又不影响输出节奏的元神技能，如增加攻击力或减少技能冷却时间的类型。同时要注意元神技能的释放时机，最好配合主力输出英雄的关键技能冷却时间，形成连贯的技能循环。
从长期发展角度看，元神技能的选择还需要考虑游戏版本更新趋势。随着玩家元神层数普遍提升，暴击属性会逐渐达到饱和状态，这时增加暴击伤害或穿透属性的元神技能价值会相应提高。迷宫高层怪物普遍具有高防御特性，能够提供防御穿透或百分比伤害的元神技能在未来版本中可能会更受青睐。玩家在培养元神技能时应保持一定前瞻性，避免资源过度集中在可能被版本调整影响的技能上。
